Возглавляет учреждение руководитель — и. о. директора ГКУ КК «Кубаньземконтроль» Диденко Константин Эдуардович
Учреждение состоит из 12 структурных подразделений.
Руководители структурных подразделений:
Краснодарский отдел земельного контроля — Гущин А.Н.
Сочинский отдел земельного контроля — Борисов В.П.
Армавирский отдел земельного контроля — Попова Е.Г.
Новороссийский отдел земельного контроля — Гаврилов П.Ф.
Тихорецкий отдел земельного контроля — Шишкина О.Ю.
Ейский отдел земельного контроля — Мелихова Л.А.
Отдел обследования объектов капитального строительства — Миков И.А.
Отдел ведения лицевых счетов — Пристёгина О.В.
Отдел формирования земельных дел — Чекалин И.В.
Отдел финансовой, кадровой и организационной работы — Певнева Е.Ю.
Общий отдел — Диденко К.Э.
Юридический отдел — Хисамов Т.Р.
